Den Zeitraum in der das Weibchen zum decken bereit ist, nennt man Brunstzeit. Dies ist ca. alle 2 Wochen für 24 Std. der Fall. Wie bei anderen Tieren auch, erkennt das Männchen es am Geruch. Das Männchen beginnt mit hin und her wackelndem Hinterteil und brummenden Geräuschen das Weibchen zu umwerben. Letztendlich kommt es zum Deckakt der sich in kurzen zeitlichen Abständen wiederholt. Ein Deckakt dauert nicht länger als ein paar Sekunden.

Die Tragzeit dauert normalerweise 68 Tage. Was darüber hinaus geht, sollte mit einem Tierarzt abgeklärt werden. Deshalb sollte man den Tag der Befruchtung, wenn möglich, notieren. Zum Anfang sieht man es dem Weibchen nicht an ob es trächtig ist. Erst nach ca. 4-5 Wochen nach dem Deckakt erkennt man, daß das Weibchen an Rundungen zunimmt. Dies macht sich an beiden Seiten des Bauches des Meerschweinchens bemerkbar. Ab diesem Zeitpunkt erhöht sich das Gewicht. Tragende Weibchen nehmen zum Teil  in dieser Zeit  bis zu einem Drittel des eigenem Körpergewichts zu.

In den letzten beiden Schwangerschaftswochen kann man die Bewegungen der Jungen fühlen. Ab dieser Zeit sollte der Bock von der Sau getrennt werden da dieser die Sau ein paar Stunden nach der Geburt wieder decken kann. Unnötiger Streß ist in dieser Zeit zu vermeiden um das Weibchen und Baby zu schonen. Deswegen sollte häufiges herausnehmen aus dem Käfig, umlagern usw. in dieser Zeit vermieden werden.

Genauso wichtig ist die Gabe von Vitamin C zur Stärkung der Abwehrkräfte.

Die Geburt:

Meerschweinchenweibchen bauen keine Nester, sie suchen sich einen für sich geeigneten Platz für die Geburt aus. Die Babys werden mit dem Kopf voran geboren. Sowie der vordere Teil des Kopfes zu sehen ist, beißt die Mutter die Eihülle auf damit das  Baby sofort atmen kann. Ist das Baby ganz geboren, durchtrennt das Muttertier die Nabelschnur und frißt den Mutterkuchen (Plazenta) und die Eihülle. Dies dient zur Milchbildung, die durch die im Mutterkuchen befindlichen Hormonen ausgelößt wird. Dann folgt auch schon das nächste Baby und dieselbe Prozedur wiederholt sich. Die Kleinen werden liebevoll von der Mutter trocken geleckt.Nach der Geburt stärkt sich das Muttertier am Futternapf. Anders als bei anderen Tierarten, darf der Vater auch bei der Geburt dabei sein. Dem Weibchen ist dies meist egal. Teilweise wirkt es auf das Weibchen auch beruhigend. Der einzige Grund das Männchen zu entfernen ist, daß das Weibchen einige Stunden nach dem letzten Wurf wieder brünstig wird und das Männchen mit dem Decken beginnt. Dann ist in 2 Monaten wieder mit Nachwuchs zu rechnen. Ist dieser Nachwuchs nicht erwünscht, sollte die Trennung aber schon einige Tage vor der Geburt geschehen. Die Geburt ansich geht erstaunlich schnell, je nach Anzahl der Jungen dauert Sie zwischen 10 und 30 Minuten. Die Anzahl der Meerschweinchenbabys liegt in der Regel zwischen 2 und 5. Das Gewicht der Neugeborenen liegt dann zwischen 40 Gramm bei mehrern Babys, und 100 Gramm bei Einzelgeburten. Meerschweinchen sind Nestflüchter d.h. sie kommen voll entwickelt zur Welt. Sie haben ein komplettes Fellkleid, die Augen sind geöffnet und das bleibende Gebiss ist vorhanden. Der Zahnwechsel findet bereits im Mutterleib statt. Bereits wenige Stunden nach der Geburt beginnen die Jungtiere ihre Umgebung zu erkunden.